Re-emergence of pertussis despite high vaccination coverage in western countries, results in increased risk for severe and even fatal pertussis among newborns. For this reason, late 2015 the Dutch Health Council (HC) advised to offer 3rd trimester pertussis vaccination to pregnant women. At the start of the maternal pertussis programme late 2019, the maternal Tdap was advised from 22w of gestation onwards. Preterms, accounting for 8% of newborns in the Netherlands, are at highest risk for severe pertussis leading to prolonged hospital and intensive care admissions and sometimes death. Recently, it has become evident that despite 3rd trimester vaccination, preterms remain at high risk because the vaccination is likely given too late for sufficient antibody transfer. For this vulnerable group 2nd trimester vaccination may offer better protection because of extended time for antibody transfer. To date, most countries recommend 3rd trimester vaccination to protect young, not yet (fully) vaccinated infants. Data from England show 91% effectiveness against infant pertussis after maternal Tetanus- diphtheria -acellular Pertussis (Tdap) vaccination in the 3rd trimester. Studies focussing on preterms and protection after maternal vaccination are scarce. Two observational studies reported on effectiveness and antibody levels in cord blood of 2nd trimester vaccination in term infants. While one study showed significantly higher antibody levels after 2nd trimester vaccination (13-25 gestational weeks; GW), another study showed decreased effectiveness of 2nd trimester (<27 GW) vaccination. Only one study concerned antibody transfer in preterms and reported higher antibody levels after 2nd (n=37) than after 3rd (n=48) trimester vaccination. Aiming to contribute to setting optimal vaccine strategy of maternal pertussis vaccination in the Netherlands and elsewhere and particular for the most vulnerable group of preterms, we propose a study that compares pertussis antibody levels in preterms and terms after 2nd trimester maternal vaccination. We can compare these to data we have on 3rd trimester Tdap in terms. In addition to adequate antibody levels, success of 2nd trimester vaccination depends on acceptance of this strategy by pregnant women and professionals. Our primary endpoint is IgG anti-pertussis toxin (Pt) antibody concentration in preterms and terms at 2m of age, Pt is considered the most relevant antibody for protection against clinical pertussis. Secondary endpoints are e.g. pertussis specific antibody concentrations in preterms and terms in cord blood and in women at delivery. Determinants of acceptance of 2nd trimester maternal vaccination are also a secondary endpoint. Antibody concentrations will be assessed in serum, using a fluorescent bead-based multiplex immunoassay, with required blood volume of minimal 100µl. For the survey on acceptance, we aim to have 4 groups of 100 women each, i.e. women who are pregnant for the 1st time, women who already gave birth and in both groups women with and without a known increased risk of preterm delivery. For the immunogenicity part, we aim to have at least 60 preterms and 60 terms, as this is, according to experts, the minimum number to enable good comparisons. Pregnant women will be offered 2nd trimester pertussis vaccination. Both among acceptors and non-acceptors acceptance of 2nd trimester vaccination will be assessed. Women are first asked to participate in the acceptance part after the 1st antenatal visit to a midwife or obstetrician. They fill in a questionnaire to assess behavioral determinants and beliefs that underlie acceptance of 2nd trimester maternal vaccination. Only after this consent, women will be asked to participate in the immunogenicity part. Hereby, women will receive Tdap after they have the 20w standard anomaly ultrasound scan (20-24 GW). Vaccinated women will be followed until delivery. All preterms and a random selection of 60 terms, all of vaccinated mothers, will be followed until 2m of age, i.e. just before start of the NIP. By including both women in primary and secondary antenatal care, we aim to enrich our study population with women who are at increased risk for preterm delivery, as these women are usually seen by an obstetrician. Data from our study will determine whether 2nd trimester Tdap leads to sufficient Pt antibodiy concentration in terms and preterms compared to 3rd trimester vaccination. Furthermore, we will have knowledge about obstacles for acceptance and can tailor information for all pregnant women to overcome these. Finally, given that in near future besides pertussis other maternal vaccines are likely to become available for prevention of severe disease in newborns (RSV, GBS), in particular in preterms, this study generates essential knowledge for future vaccine policy of maternal vaccines.

<p>Datasets used for the manuscript:&nbsp;<em>Long-term wastewater monitoring of SARS-CoV-2 viral loads and variants at the major international passenger hub Amsterdam Schiphol Airport: a valuable addition to COVID-19 surveillance</em></p> <p><em>pandemic_daily_passenger_counts.tsv</em>: An overview of daily passenger arrival&nbsp;counts at Amsterdam Schiphol Airport per continent of origin during the study period 16-02-2020 - 04-09-2022</p> <p><em>pre-pandemic_daily_passenger_averages.tsv:&nbsp;</em>An overview of mean daily passenger arrival counts at Amsterdam Schiphol Airport in the pre-pandemic period 2017-2019.</p> <p><em>viral_load_data.tsv:&nbsp;</em>Flow-corrected viral load (# particles per 24h) in samples taken at the wastewater treatment plant of Amsterdam Schiphol Airport.</p> <p><em>wastewater_variant_frequencies.tsv:&nbsp;</em>SARS-CoV-2 lineage estimates in samples&nbsp;taken at the wastewater treatment plant of Amsterdam Schiphol Airport, analyzed using whole-genome tiled amplicon sequencing.</p>

Genexpressie in muizen om invloed van verschillende soorten dieet te bepalen op nierschade door ischemia-reperfusie bij operatie.

For English, see below Nederland heeft voor het SARS-CoV-2 virus (coronavirus) een endemische fase bereikt en de GGD teststraten zijn per 17 maart 2023 gesloten. Daardoor wordt de data vanaf 1 april 2023 niet meer bijgewerkt. Bestand vanaf week 40, 2021: COVID-19_casus_landelijk Bestand tot en met week 39, 2021: COVID-19_casus_landelijk_tm Dit bestand wordt vanaf versie 5 niet meer geüpdatet (zie hieronder) Beschikbare formaten: .csv en .json Bronsysteem: OSIRIS Algemene Infectieziekten (AIZ) Beschrijving bestand: Dit bestand bevat de volgende karakteristieken per positief geteste casus in Nederland: Datum voor statistiek, Leeftijdsgroep, Geslacht, Overlijden, Week van overlijden, Provincie, Meldende GGD Het bestand is als volgt opgebouwd: Een record voor elke laboratorium bevestigde COVID-19 patiënt in Nederland, sinds het begin van de pandemie. Vanaf 11 juli 2022 is deze data opgesplitst (zie beschrijving versie 5). Alleen het bestand vanaf week 40, 2021 wordt iedere dinsdag en vrijdag om 16:00 ververst, op basis van de gegevens zoals op 10:00 uur die dag geregistreerd staan in het landelijk systeem voor meldingsplichtige infectieziekten (Osiris AIZ). Het historische bestand (tot en met week 39, 2021) wordt vanaf 11 juli niet meer geüpdatet. Beschrijving van de variabelen: Version: Versienummer van de dataset. Wanneer de inhoud van de dataset structureel wordt gewijzigd (dus niet de dagelijkse update of een correctie op record niveau), zal het versienummer aangepast worden (+1) en ook de corresponderende metadata in RIVMdata (https://data.rivm.nl). Versie 2 update (20 januari 2022): - In versie 2 van deze dataset is de variabele ‘hospital_admission’ niet meer beschikbaar. Voor het aantal ziekenhuisopnames wordt verwezen naar de geregistreerde ziekenhuisopnames van Stichting NICE (data.rivm.nl/covid-19/COVID-19_ziekenhuisopnames.html). Versie 3 update (8 februari 2022) - Vanaf 8 februari 2022 worden de positieve SARS-CoV-2 testuitslagen rechtstreeks vanuit CoronIT aan het RIVM gemeld. Ook worden de testuitslagen van andere testaanbieders (zoals Testen voor Toegang) en zorginstellingen (zoals ziekenhuizen, verpleeghuizen en huisartsen) die hun positieve SARS-CoV-2 testuitslagen via het Meldportaal van GGD GHOR invoeren rechtstreeks aan het RIVM gemeld. Meldingen die onderdeel zijn van de bron- en contactonderzoek steekproef en positieve SARS-CoV-2 testuitslagen van zorginstellingen die via zorgmail aan de GGD worden gemeld worden wel via HPZone aan het RIVM gemeld. Vanaf 8 februari wordt de datum van de positieve testuitslag gebruikt en niet meer de datum van melding aan de GGD Versie 4 update (24 maart 2022): - In versie 4 van deze dataset zijn records samengesteld volgens de gemeente herindeling van 24 maart 2022. Zie beschrijving van de variabele Municipal_health_service voor meer informatie. Versie 5 update (11 juli 2022): - Vanaf 11 juli 2022 is deze dataset opgesplitst in twee delen. Het eerste deel bevat de data vanaf het begin van de pandemie tot en met 3 oktober 2021 (week 39) en bevat ‘tm’ in de bestandsnaam. Deze data wordt niet meer geüpdatet. Het tweede deel bevat de data vanaf 4 oktober 2021 (week 40) en wordt iedere werkdag geüpdatet. Versie 6 update (1 september 2022): - Vanaf 1 september 2022 wordt het tweede deel van de data (vanaf week 40 2021) niet meer iedere werkdag geüpdatet, maar op dinsdagen en vrijdagen. De data wordt op deze dagen met terugwerkende kracht bijgewerkt voor de andere dagen. Versie 7 update (3 januari 2023): - Per 1 januari 2023 verzamelt het RIVM geen aanvullende informatie meer. Dit heeft als gevolg dat we vanaf 1 januari 2023 geen overlijdens meer rapporteren en worden de kolommen [Deceased] en [Week of Death] niet meer aangevuld. Date_file: Datum en tijd waarop de gegevens zijn gepubliceerd door het RIVM Date_statistics: Datum voor statistiek; eerste ziektedag, indien niet bekend, datum lab positief, indien niet bekend, melddatum aan GGD (formaat: jjjj-mm-dd) Date_statistics_type: Soort datum die beschikbaar was voor datum voor de variabele "Datum voor statistiek", waarbij: DOO = Date of disease onset : Eerste ziektedag zoals gemeld door GGD. Let op: het is niet altijd bekend of deze eerste ziektedag ook echt al Covid-19 betrof. DPL = Date of first Positive Labresult : Datum van de (eerste) positieve labuitslag. DON = Date of Notification : Datum waarop de melding bij de GGD is binnengekomen. Agegroup: Leeftijdsgroep bij leven; 0-9, 10-19, ..., 90+; bij overlijden <50, 50-59, 60-69, 70-79, 80-89, 90+, Unknown = Onbekend Sex: Geslacht; Unknown = Onbekend, Male = Man, Female = Vrouw Province: Naam van de provincie (op basis van de verblijfplaats van de patiënt) Deceased: Overlijden. Unknown = Onbekend, Yes = Ja, No = Nee. Vanaf 1 januari 2023 is deze kolom leeg. Week of Death : Week van overlijden. YYYYMM volgens ISO-week notatie (start op maandag t/m zondag). Vanaf 1 januari 2023 is deze kolom leeg. Municipal_health_service: GGD die de melding heeft gedaan. Vanaf 24 maart 2022 is dit bestand samengesteld volgens de gemeente indeling van 24 maart 2022. Gemeente Weesp is opgegaan in gemeente Amsterdam. Met deze indeling is de veiligheidsregio Gooi- en Vechtstreek kleiner geworden en de veiligheidsregio Amsterdam-Amstelland groter; GGD Amsterdam is groter geworden en GGD Gooi- en Vechtstreek is kleiner geworden (https://www.cbs.nl/nl-nl/onze-diensten/methoden/classificaties/overig/gemeentelijke-indelingen-per-jaar/indeling-per-jaar/gemeentelijke-indeling-op-1-januari-2022). -------------------------------------------------------------------------------- Covid-19 characteristics per case, nationwide The Netherlands has reached an endemic phase for the SARS-CoV-2 virus (coronavirus) and the PHS testing facilities will be closed as of March 17, 2023. As a result, the data will no longer be updated from 1 April 2023. File from week 40, 2021: COVID-19_case_landelijk File up to and including week 39, 2021: COVID-19_casus_landelijk_tm This file will no longer be updated from version 5 (see below) Available formats: .csv and .json Source system: OSIRIS General Infectious Diseases (AIZ) File description: This file contains the following characteristics per positively tested case in the Netherlands: Date for statistics, Age group, Gender, Death, Week of death, Province, Notifying PHS The file is structured as follows: A record for every lab-confirmed COVID-19 patient in the Netherlands since the start of the pandemic. From July 11, 2022, this data has been split (see description version 5). Only the file from week 40, 2021 onwards will be updated every Tuesday and Friday at 4:00 PM, based on the data as registered at 10:00 AM that day in the national system for notifiable infectious diseases (Osiris AIZ). The historical file (up to and including week 39, 2021) will no longer be updated from July 11, 2022. Description of the variables: Version: Version number of the dataset. When the content of the dataset is structurally changed (so not the daily update or a correction at record level), the version number will be adjusted (+1) and also the corresponding metadata in RIVMdata (https://data.rivm.nl). Version 2 update (January 20, 2022): - In version 2 of this dataset, the variable 'hospital_admission' is no longer available. For the number of hospital admissions, reference is made to the registered hospital admissions of the NICE Foundation (data.rivm.nl/covid-19/COVID-19_ziekenhuis Admissions.html). Version 3 update (February 8, 2022) - From 8 February 2022, positive SARS-CoV-2 test results will be reported directly from CoronIT to the RIVM. The test results of other test providers (such as Testing for Access) and healthcare institutions (such as hospitals, nursing homes and general practitioners) that enter their positive SARS-CoV-2 test results via the Reporting Portal of GGD GHOR are also reported directly to the RIVM. Reports that are part of the source and contact investigation sample and positive SARS-CoV-2 test results from healthcare institutions that are reported to the PHS via healthcare email are reported to the RIVM via HPZone. From 8 February 2022, the date of the positive test result is used and no longer the date of notification to the PHS. Version 4 update (March 24, 2022): - In version 4 of this dataset, records are compiled according to the municipality reclassification of March 24, 2022. See description of the Municipal_health_service variable for more information. Version 5 Update (July 11, 2022): - As of July 11, 2022, this dataset is split into two parts. The first part contains the dates from the start of the pandemic to October 3, 2021 (week 39) and contains "tm" in the file name. This data will no longer be updated. The second part contains the data from October 4, 2021 (week 40) and is updated every working day. Version 6 update (September 1, 2022): - From September 1, 2022, the second part of the data (from week 40 2021) will no longer be updated every working day, but on Tuesdays and Fridays. The data is retroactively updated on these days for the other days. Version 7 update (January 3, 2023): - As of 1 January 2023, the RIVM will no longer collect additional information. As a result, we will no longer report deaths from January 1, 2023 and the [Deceased] and [Week of Death] columns will no longer be completed. Date_file: Date and time when the data was published by the RIVM Date_statistics: Date for statistics; first day of illness, if not known, date of positive lab result, if not known, reporting date to PHS (format: yyyy-mm-dd) Date_statistics_type: Type of date that was available for date for the "Date for statistics" variable, where: DOO = Date of disease onset : First day of illness as reported by PHS. Please note: it is not always known whether this first day of illness actually concerned Covid-19. DPL = Date of first Positive Lab result : Date of the (first) positive lab result. DON = Date of Notification : Date on which the notification was received by the PHS. Agegroup: Age group alive; 0-9, 10-19, ..., 90+; at death <50, 50-59, 60-69, 70-79, 80-89, 90+, Unknown = Unknown Sex: Gender; Unknown = Unknown, Male = Male, Female = Female Province: Name of the province (based on the patient's residence) Deceased: Death. Unknown = Unknown, Yes = Yes, No = No. From January 1, 2023, this column will be empty. Week of Death : Week of death. YYYYMM according to ISO week format (starts on Monday to Sunday). From January 1, 2023, this column will be empty. Municipal_health_service: PHS that made the report. From March 24, 2022, this file has been compiled according to the municipality classification of March 24, 2022. The municipality of Weesp has been merged into the municipality of Amsterdam. With this merger, the Gooi- en Vechtstreek security region has become smaller and the Amsterdam-Amstelland security region larger; GGD Amsterdam has become larger and GGD Gooi- en Vechtstreek has become smaller (https://www.cbs.nl/nl-nl/onze-diensten/methoden/classificaties/overig/gemeentelijke-indelingen-per-jaar/indeling-per-jaar/gemeentelijke-indeling-op-1-januari-2022).

Deze dataset bevat de emissies en afvalstromen vanuit de belangrijkste industriële faciliteiten in Nederland zoals deze met het elektronisch Milieujaarverslag worden verzameld in het kader van de Europese E-PRTR verplichting door RIVM aan de Europese Unie worden gerapporteerd. Het bevoegd gezag (provincie, gemeente, waterschap, omgevingsdienst etc.) van het bedrijf heeft vooraf de emissies en afvalstromen gevalideerd. Deze dataset betreft de hoeveelheid gevaarlijk en niet gevaarlijk afval, hierbij gaat het om jaarvrachten.

Het RIVM maakt elk jaar kaarten van de luchtverontreiniging in Nederland. Dit gebeurt voor verschillende stoffen in de lucht, waaronder stikstofdioxide en fijnstof. Het RIVM gebruikt zowel modelberekeningen als metingen om deze GCN(Grootschalige Concentratiekaarten Nederland)-kaarten te maken. Zo komen de concentraties het best overeen met de werkelijke situatie in het afgelopen jaar. Slechte luchtkwaliteit is schadelijk voor de gezondheid. De GCN-kaarten worden gebruikt om de ontwikkeling van de luchtkwaliteit in Nederland te volgen. Overheden gebruiken de toekomstverwachtingen om beleid te maken voor een betere luchtkwaliteit. Deze dataset bevat de gegevens vanaf 2024. Bron: RIVM, Grootschalige concentratiekaarten Nederland

Genexpressie in rattenlong na inhalatie van EHC-93 fijnstof

De geprognosticeerde reeks stikstofdepositie bevat de deposities (mol/hectare/jaar) per hexagon van 16 hectare van 2020, 2023, 2025, 2030 en 2035 voor vastgesteld en voorgenomen beleid. Het betreft alleen hexagonen waar een stikstofgevoelig natuurtype in Natura 2000 voorkomt. Voor de prognosejaren zijn de berekeningen gedaan met langjarig-gemiddelde meteorologie en gekalibreerd aan vijf recente jaren aan metingen.

Bevat de emissies van stoffen naar de lucht en het brandstofverbruik van de grote vuurhaarden in Nederland (Large Combustion Plants) over het rapportagejaar 2016.

Data is niet algemeen beschikbaar. CC-BY 4.0 licentie betreft de metadata niet de dataset De NECCST dataset omvat gegevens van 5700 vrouwen in Nederland die ooit hebben meegedaan aan de chlamydia screening implementatie tussen 2008 en 2011 en toen hebben aangegeven benaderd te kunnen worden voor vervolgonderzoek naar seksueel overdraagbare aandoeningen. Dat is in 2015 gebeurd in het kader van de Nederlandse chlamydia cohort studie (NECCST). Door middel van een informed consent kregen vrouwen toegang tot een online vragenlijst met vragen over demografie, chlamydia historie, zwangerschappen, lange termijn complicaties van chlamydia zoals chronische buikpijn, buitenbaarmoederlijke zwangerschappen, infertiliteit, anticonceptie en seksueel risico gedrag. De vragen opnieuw gesteld in 2017 en 2019. The NECCST dataset contains information of 5700 females in the Netherlands who participated in the Chlamydia Screening Implementation project between 2008 and 2011. All women that agreed to be asked for follow-up research were invited to participate in the Netherlands Chlamydia Cohort Study in 2015. After informed consent women answered questions in an online survey on demographics, history of chlamydia, pregnancies, long term complications of chlamydia like pelvic inflammatory disease (PID), ectopic pregnancies, tubal factor infertility, anticonception and sexual risk behavior. Other questionnaire rounds took place in 2017 and 2019.